En el 2004, se inicia la gestión para realizar un estudio de mercado y gestionar ante el ICFES, un nuevo registro calificado para la Especialización en Gerencia en Salud, propia de la Universidad. En 2007, la Especialización reabre su Tercera, Cohorte, el 14 de septiembre, bajo la Coordinación Académica de la Enfermera, Aleydis Julio Peterson; durante este periodo se dio una reestructuración Curricular, con cambio en el número de créditos y en los contenidos de los micro currículos; se dio la vinculación de nuevos docentes adscritos a Universidad Popular del Cesar y otras Universidades del país.