A partir del año 1998 las Universidades Estatales del Caribe Colombiano se constituyeron en un primer convenio con el propósito de colaborarse entre sí para la consecución de la Acreditación Previa de los Programas de Educación. Posteriormente, se convocó a la Comunidad Académica Regional para el desarrollo de tres proyectos colectivos de programas de maestría, los cuales fueron: Maestría en Ciencias Físicas, Maestría en Ciencias Ambientales y Maestría en Educación, obteniendo el Registro Calificado por el Ministerio de Educación Nacional -MEN en el año 2005 y renovados durante los períodos 2012 y 2013.