Durante tres años consecutivos (2007-2010) las universidades miembros de la Red llevaron a cabo un esfuerzo mancomunado para estructurar y construir el programa de Doctorado en Ciencias Físicas analizando todas las condiciones, con las que contaba la Región Caribe en ese entonces, relacionadas con el desarrollo de tesis doctorales como: el recurso docente existente, la infraestructura y las capacidades de los grupos de investigación. Adicionalmente, durante la construcción del programa se tuvo en cuenta el recurso humano potencial de la región, egresados de los programas de pregrado en el área disciplinar de la Física y de otras disciplinas afines como Química, Matemáticas e Ingenierías, quienes requerían o deseaban ampliar sus estudios de formación a nivel de postgrado.